Основният курс по Органична химия се изучава в две части. Систематичната част на лекционния курс по органична химия като цяло е изградена върху функционалната класификация на органичните съединения. Целта на първата част от курса е студентите да се запознаят с теоретичните представи в органичната химия  за  изграждането молекулите на органичните съединения, химичните връзки и електронните ефекти в тях. Разглеждат се механизмите на основните типове реакции, с оглед по-пълното вникване в тяхната същност. Акцентира се върху номенклатурата на органичните съединения и явлението изомерия в различните му проявления. Следва разглеждането на най-простите по състав и структура органични съединения, каквито са въглеводородите. Целта на втората част от курса по Oрганична химия е студентите да се запознаят с основните класове функционални производни на въглеводородите и закономерностите, на които се подчинява тяхната реактивоспособност. Разглеждат се структурата и реакционната способност на халогено-, кислород- и азотсъдържащи производни на въглеводородите. Наред с това се добавят и познания за методите за получаване, разпостранението, приложението и токсичното им действие, както и някои трансформации на органичните вещества в живите организми.

Темите от семинарните занятия целят усвояване на лекционния материал чрез решаване на задачи с развитие на творческото мислене на студентите.