Курсът по Стереохимия включва задълбочено разглеждане на причините за съществуване на стереоизомерите, дефинират се основните понятия „конституция“, „конфигурация“ и „конформация“. Конфигурационнната изомерия се разглежда въз основа хиралността на цялата молекула (при наличие на хирален център, хирална ос, хирална равнина, спиралност), както при ациклени, така и при циклените съединения. Студентите се запознават със свойствата и методите за разделяне на рацемични форми на отделните енантиомери. Онагледяването е с примери от природната и лекарствена химия. Конформационният анализ застъпва и ациклични, и циклични съединения с изясняване на факторите, определящи стабилността на конформерите. Разглежда се връзката между енантиомерия, диастереомерия и конформационна изомерия при заместени циклоалкани. Номенклатурните правила на IUPAC се прилагат за наименоването на стереоизомери при много природни и лекарствени съединения като задачи в рамките на лекционния курс.

И накрая се разглеждат стереохимичните особености на примерни реакции на елиминиране, нуклеофилно заместване и присъединителни реакции.